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Material Studio材料模拟计算的工作站配置方案


网络 【转载】 2011年08月03日 05:00 评论

  XASUN是当今市场唯一能提供塔式、超级、机架、便携、特种等图形工作站全方面解决方案的品牌。拥有完整、完美、可靠、静音的高性能计算机全套产品系列,为行业用户提供超级强劲性能、高效的定制专业级工作站配置方案。

  MaterialsStudio是一套材料科学的仿真软件,MS是在化学和材料领域,为结构和计算器研究者所设计的专业仿真软件,提供用户流畅的操作接口,并包含完整的运算方法,让使用者容易上手并提供功能强大的仿真能力。

  研究者通过MS提供的先进丰富多种算法进行综合分析计算,在性质预测、聚合物建模还是X射线衍射模拟,通过一些简单易学的操作来得到切实可靠的数据。协助科学家解决重要问题,研发世界上最先进的材料。


Material Studio材料模拟计算的图形工作站配置方案

  XASUN当今世界唯一能提供塔式、机架、便携式、特种结构等规格,提供单路、双路、四路、八路最先进架构的高端图形工作站,XASUN紧随世界领先的intel和AMD的计算处理硬件主流技术,和NvidiaATI高性能图卡以及一流的硬盘阵列技术,打造出具有超级性能的XASUN图形工作站和服务器,同时充分了解不同行业应用软件的计算特点,灵活方便的配置架构,使应用软件在任何一台支持基于Windows、Linux等主流操作系统的服务器或工作站上最高效率的进行运算,从而最大限度的发挥工作站硬件性能和网络资源。

  分子模拟(材料计算)求解过程计算特点分析

  主要集中在对CPU内存方面,MS软件支持主流CPU的多核并行计算,在一个架构里,频率越高,核数,计算速度越快,内存方面主要体现在计算的规模上,随着对自然世界的深入了解和分析,分析精度越来越高,计算量也越来越大,对内存的要求也在不断递增,由于求解运算过程中大量时间都在计算中,对显卡的要求自然不高,图卡主要是后期对数据的可视化有些需求,另外MS软件运算特点是将数据一次性放到内存进行密集计算,自然对硬盘外设的读写不是很频繁,传统上SATA接口也足够了,如果内存不够,虚拟内存很大的话,推荐SAS硬盘,当然将来SSD便宜下来,内存和虚拟内存的比例1:2,可以考虑采用SSD硬盘

Material Studio材料模拟计算的图形工作站配置方案

  硬件配置关系注意事情:

  1.经过厂家推荐,目前12核不建议使用,8核Xeon架构效率更高

  2.CPU-内存关系,1核---对应配置---2G~4G,8核处理器对应内存16GB~32GB.

  3.显卡要求不高,针对不同的计算规模,配置相应档次图卡,满足后期数据可视化需求。

  4.硬盘IO在计算过程中,影响不大,资金充足的话,视多种计算软件,SAS6Gbps是目前相当不错的选择

  XASUN图形工作站配置方案

  MS软件配备丰富的应用功能模块,硬件如何配合好所有软件模块,非一般经验的硬件工程师所能了解的,今天我们对计算规模按原子数量初步划分,大致分三个档次:

  1.小规模计算工作站配置方案

  定位:原子数不超过100个求解规模

  推荐:4核Xeon3470(2.93G)/16GB/Quadro600/1TBSATA

  机器型号XASUNT512912-T1AA

Material Studio材料模拟计算的图形工作站配置方案

  2.中大规模计算高端图形工作站配置方案

  应用定位:原子数100~1000个之间求解规模

  推荐:8核XeonX5677(3.46G)/24GB/quadro2000/1TBSAS

  如果从软件和硬件的价格对比,买一台配置最高的图形工作站,是最好的发挥软件性能的不二选择。

  机器型号XASUNT523524-A1AB

  参考配置:

Material Studio材料模拟计算的图形工作站配置方案

  3.超大规模计算分布式集群服务器解决方案

  定位:原子数1000个以上求解规模

  下面的方案主要是基于办公环境的计算应用,Xeon架构的计算机单机性能越来越强大,最新Xeon5600和单核时代的Xeon相比,快15倍以上,所以基于办公环境的小集群(40核以内),放在办公环境,计算性能满足大部分应用,同时也便于维护和使用。

Material Studio材料模拟计算的图形工作站配置方案
22U高度(4U*5+1U+1U)

  集群方案:

  管理节点配置:8核XeonE5605(2.13G)/8GB/600GSAS+4*1TBSATA

  计算节点配置:8核XeonE5640(2.66G)/24GB/500GSATA

  计算节点数量:4个

  硬件参考配置方案

  1.图形管理服务器(管理节点)

Material Studio材料模拟计算的图形工作站配置方案

    机器型号:XASUNR522724-T8ARC

Material Studio材料模拟计算的图形工作站配置方案

  2计算节点

Material Studio材料模拟计算的图形工作站配置方案

  机器型号XASUNX5600U22748AD

Material Studio材料模拟计算的图形工作站配置方案

  3.服务器集群设备汇总表

Material Studio材料模拟计算的图形工作站配置方案

  工作站配置报价咨询

  北京太阳HPC应用中心www.xasun.com

  电话:400-705-6800

 

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